Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PAF1Q8N7H5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAF1Q8N7H5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAF1Q8N7H5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAF1Q8N7H5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAF1Q8N7H5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.5 ms