Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00612Q8N6U2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00612Q8N6U2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00612Q8N6U2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms