Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIP4Q8N3C7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIP4Q8N3C7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP4Q8N3C7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP4Q8N3C7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms