Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PQLC1Q8N2U9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PQLC1Q8N2U9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PQLC1Q8N2U9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PQLC1Q8N2U9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms