Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC13Q8IYE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC13Q8IYE1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC13Q8IYE1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC13Q8IYE1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms