Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC50Q8IVM0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC50Q8IVM0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC50Q8IVM0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC50Q8IVM0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms