Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms