Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHSY1Q86X52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHSY1Q86X52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHSY1Q86X52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY1Q86X52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHSY1Q86X52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHSY1Q86X52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHSY1Q86X52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHSY1Q86X52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHSY1Q86X52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHSY1Q86X52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms