Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD3Q86UT5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD3Q86UT5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD3Q86UT5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD3Q86UT5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms