Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDF3Q7Z739 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDF3Q7Z739 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YTHDF3Q7Z739 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YTHDF3Q7Z739 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YTHDF3Q7Z739 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms