Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC24A5Q71RS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC24A5Q71RS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC24A5Q71RS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC24A5Q71RS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC24A5Q71RS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A5Q71RS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms