Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4BQ6ZWI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFPL4BQ6ZWI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFPL4BQ6ZWI9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms