Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPOR1Q6ZS17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPOR1Q6ZS17 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR1Q6ZS17 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR1Q6ZS17 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms