Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf47Q6ZRZ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf47Q6ZRZ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms