Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM198BQ6UWH4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM198BQ6UWH4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM198BQ6UWH4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM198BQ6UWH4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM198BQ6UWH4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms