Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTA2Q6UW10 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTA2Q6UW10 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTA2Q6UW10 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTA2Q6UW10 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms