Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD3Q6STE5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD3Q6STE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD3Q6STE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms