Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DCLRE1AQ6PJP8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DCLRE1AQ6PJP8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCLRE1AQ6PJP8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLRE1AQ6PJP8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DCLRE1AQ6PJP8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms