Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGB2Q6NT52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGB2Q6NT52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CGB2Q6NT52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CGB2Q6NT52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGB2Q6NT52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms