Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18B1Q6NT16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18B1Q6NT16 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18B1Q6NT16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18B1Q6NT16 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18B1Q6NT16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18B1Q6NT16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18B1Q6NT16 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18B1Q6NT16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms