Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT80Q6KB66 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT80Q6KB66 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT80Q6KB66 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT80Q6KB66 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms