Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms