Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIST2H2AA3Q6FI13 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2AA3Q6FI13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2AA3Q6FI13 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2AA3Q6FI13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIST2H2AA3Q6FI13 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIST2H2AA3Q6FI13 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIST2H2AA3Q6FI13 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2AA3Q6FI13 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIST2H2AA3Q6FI13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms