Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9BQ674R7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG9BQ674R7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9BQ674R7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG9BQ674R7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms