Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT4Q643R3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT4Q643R3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT4Q643R3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT4Q643R3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms