Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
USPL1Q5W0Q7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USPL1Q5W0Q7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USPL1Q5W0Q7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USPL1Q5W0Q7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USPL1Q5W0Q7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USPL1Q5W0Q7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms