Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT6Q5T7P8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT6Q5T7P8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT6Q5T7P8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT6Q5T7P8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT6Q5T7P8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms