Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAP1Q5SW96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAP1Q5SW96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAP1Q5SW96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms