Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VARS2Q5ST30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VARS2Q5ST30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VARS2Q5ST30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VARS2Q5ST30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VARS2Q5ST30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VARS2Q5ST30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VARS2Q5ST30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VARS2Q5ST30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms