Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM201Q5SNT2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM201Q5SNT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM201Q5SNT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM201Q5SNT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM201Q5SNT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM201Q5SNT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM201Q5SNT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms