Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM48Q5RL73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM48Q5RL73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM48Q5RL73 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms