Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK2Q5EBM0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMPK2Q5EBM0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMPK2Q5EBM0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMPK2Q5EBM0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms