Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIPR1Q53HC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIPR1Q53HC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EIPR1Q53HC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIPR1Q53HC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms