Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF20Q3BBV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NBPF20Q3BBV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF20Q3BBV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF20Q3BBV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF20Q3BBV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF20Q3BBV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF20Q3BBV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF20Q3BBV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF20Q3BBV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF20Q3BBV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF20Q3BBV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms