Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGS1Q32NB8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGS1Q32NB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGS1Q32NB8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PGS1Q32NB8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms