Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HKDC1Q2TB90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HKDC1Q2TB90 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HKDC1Q2TB90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HKDC1Q2TB90 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HKDC1Q2TB90 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms