Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR1Q2NL82 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR1Q2NL82 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSR1Q2NL82 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR1Q2NL82 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms