Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIDA1Q1XH10 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIDA1Q1XH10 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKIDA1Q1XH10 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms