Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPROQ16827 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPROQ16827 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPROQ16827 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPROQ16827 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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