Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NREPQ16612 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NREPQ16612 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NREPQ16612 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NREPQ16612 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NREPQ16612 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NREPQ16612 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NREPQ16612 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NREPQ16612 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NREPQ16612 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NREPQ16612 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NREPQ16612 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NREPQ16612 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NREPQ16612 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NREPQ16612 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NREPQ16612 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NREPQ16612 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NREPQ16612 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NREPQ16612 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NREPQ16612 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NREPQ16612 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NREPQ16612 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NREPQ16612 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NREPQ16612 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NREPQ16612 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NREPQ16612 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NREPQ16612 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NREPQ16612 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NREPQ16612 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NREPQ16612 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NREPQ16612 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NREPQ16612 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NREPQ16612 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NREPQ16612 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NREPQ16612 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NREPQ16612 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NREPQ16612 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NREPQ16612 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NREPQ16612 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NREPQ16612 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NREPQ16612 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NREPQ16612 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NREPQ16612 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NREPQ16612 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NREPQ16612 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NREPQ16612 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NREPQ16612 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NREPQ16612 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NREPQ16612 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NREPQ16612 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NREPQ16612 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NREPQ16612 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NREPQ16612 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NREPQ16612 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NREPQ16612 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NREPQ16612 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NREPQ16612 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NREPQ16612 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NREPQ16612 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms