Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCAQ16586 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCAQ16586 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCAQ16586 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCAQ16586 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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