Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR1Q16570 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR1Q16570 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR1Q16570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACKR1Q16570 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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