Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRR4Q16378 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRR4Q16378 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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