Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1CQ15572 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1CQ15572 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1CQ15572 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF1CQ15572 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1CQ15572 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF1CQ15572 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF1CQ15572 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
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