Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF13Q15543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF13Q15543 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF13Q15543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF13Q15543 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF13Q15543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms