Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN3Q15417 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNN3Q15417 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNN3Q15417 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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