Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms