Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC7Q15024 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC7Q15024 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC7Q15024 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC7Q15024 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC7Q15024 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC7Q15024 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC7Q15024 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC7Q15024 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC7Q15024 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms