Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC1AQ14683 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMC1AQ14683 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMC1AQ14683 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMC1AQ14683 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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