Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms