Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM39Q14498 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM39Q14498 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM39Q14498 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM39Q14498 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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